1999版100元券在保留了第四套人民幣較為成功的防偽技術的基礎上，又采用了一些新的具有世界先進水平的防偽技術。其中大眾防偽特征主要有以下幾個方面:

(1)固定人像水印:在99版100元、99版50元人民幣的正面左側空白處，通過迎光透視，可以看見與主景人像相同.并具有層次豐富、立體感很強的***頭像水印。

(2)紅、藍彩色纖維:從99版100元、99版50元人民幣的票面空白處可以清晰地看到紙張中有紅、藍兩色的短纖維。這些纖維不規(guī)則地分布在紙張中，與紙張很好地結合在一起。

(3)磁性微縮文字安全線:迎光觀察可見在99版100元、99版50元人民幣的正面中間偏左分別有一條帶有微縮文字“RMB 100" , "RMB50"字樣的磁性安全線。

(4)手工雕刻頭像:正面主景均為***頭像，采用具有中國傳統(tǒng)特色的手工雕刻技術，形象逼真、傳神，層次豐富，凹凸感強，具有較強的立體感和獨特的藝術效果。

(5)隱性面額數字:在正面右上方有一橢圓形圖案，將鈔票置于與眼睛近于平行的位置，面對光源做平面旋轉45度或90度角。分別可以看到面額數字“100","50”的字樣，而垂直于紙面觀察，則看不到數字。

(6)光變油呂面額數字:在99版100元、99版50元人民幣正面左下方用新型油墨印刷有面額數字"100","50"字樣，當與票面垂直角度觀察其為綠色，而傾斜一定角度則變?yōu)樗{色。

(7)陰陽互補對印圖案:在票面正面左下角和背面右下方各有一圓形局部圖案，透光觀察，正、背面圖案組合成一個完整的古錢幣圖案。

(8)雕刻凹版印刷:票面正面***頭像、中國人民銀行行名、面額數字、育文面額標記及背面主景人民大會堂、漢語拼音行名、少數民族文字等均采用雕刻凹版印刷，用手指觸摸有明顯的凹凸感。

(9)橫豎雙號碼:99版100元、99版50元人民幣正面印有橫豎雙號碼(均為兩位冠字、八位號碼)，其中橫號碼均為黑色，豎號碼分別為藍色和紅色。

(10)膠印縮微文字:100元人民幣正面上方橢圓形圖案中，多處印有“RMB”和“RMB100”的縮微文字字樣，50元的為“50”和“RMB50”。